軽自動車税は、4月1日現在、阿蘇市内に原動機付自転車、軽自動車、小型特殊自動車を所有している人に課税されます。（平成27年度より税額が改正されました。詳しくは「軽自動車税の額変更のお知らせ」をご覧ください。）
合併前のナンバープレート（125cc以下のバイク、農耕用トラクター等）の切替（一の宮町、阿蘇町、波野村から阿蘇市への切替）については、市役所本庁税務課窓口のみで行なっています。廃車及び新規登録につきましては、本庁及び支所（内牧支所・波野支所）で受け付けています。
登録変更等について
転居・転出の場合や名義人が既に死亡されている場合等は、すみやかに提出をお願いします。（阿蘇市役所本庁及び各支所で受け付けています。）
身体障害者等の軽自動車減免の手続きについて
| 対象となる軽自動車 | 軽自動車の運転者 | 使用目的 | 減免申請に必要な書類等 | 減免の状況等 |
| 所有者が身体障害者の方の軽自動車 | 身体障害者本人 | 特に問わない | 身障者手帳・戦傷病者手帳・療育手帳・精神障害者保健福祉手帳・車検証・運転免許証・印鑑 | 身障者手帳・戦傷病者手帳・療育手帳・精神障害者保健福祉手帳を持っている人 ※障害の程度により減免の対象とならない場合もあります。 車検証に自家用と記載されているもの（所有者は上記手帳所有者） 減免台数は障害者1人につき1台（普通車・軽自動車の何れか1台に限る） |
| 身体障害者等と生計を一にする者 身体障害者等を常時介護する者 |
身体障害者等の通学・通院・通所・通勤・生業のために使用するもの。 | 上記のほか、 通学・・・通学証明書 通院・・・通院証明書 通所・・・通所証明書 通勤・・・通勤証明書 生業・・・所得証明書 等のいずれか 身体障害者等を常時介護する方は、併せて常時介護証明が必要です |
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| 社会福祉法人の福祉施設専用軽自動車（第1種社会福祉事業を営む施設であることが条件） | 特に問わない | 利用者の送迎や供与物品の輸送専用車 | 車検証（写し）・自動車運行状況書（運行日誌の写し）・福祉施設の設立認可書（写し） | 第1種社会福祉事業を営む施設（社会福祉法第2条）に該当する社会福祉法人が所有または使用する軽自動車（特別養護老人ホーム、障害者支援施設等）
福祉施設において利用者の送迎や供与物品の輸送専用車 第2種＝老人デイサービス事業、老人在宅介護事業等は該当しません。 |