本庁・各支所の位置図｜各課への直通電話番号一覧｜窓口受付時間｜庁舎のフロアガイド
| 主な業務内容 | 窓口 | |||
| 阿蘇市役所 | 内牧支所 | 波野支所 | ||
| 緊急 | 防災・災害・交通安全 | 防災情報課 | 総務振興係 | 総務振興係 |
| 戸籍 住基 |
戸籍の届出・転入・転出 | 市民課 | 市民係 | 市民係 |
| 在留管理（外国人） | ||||
| 印鑑証明 | ||||
| 各種証明（戸籍・住民票の写し） | ||||
| パスポート申請 | ||||
| 市税 | 市税等の納付 | 会計課 | 会計室（総務係） | 会計室（総務係） |
| 所得証明・納税証明 | 税務課 | 市民係 | 市民係 | |
| 固定資産評価証明、資産証明 | ||||
| 公課証明 | ||||
| 固定資産名寄せ台帳の写し | ||||
| 原動機付自転車（125CC以下のバイク）・農耕用車両等の登録・廃車 | ||||
| 地図 | 税務課 （旧一の宮町の地図･字図、旧阿蘇町の地図） |
市民係 （旧阿蘇町の地図・字図） |
市民係 （旧波野村の地図・字図） |
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| 固定資産名寄せ台帳の縦覧 | 税務課 | ― | ― | |
| 国保・年金 | 国民健康保険 | ほけん課 | 市民係 | 市民係 |
| 後期高齢者医療 | ||||
| 国民年金 | ||||
| 介護保険 | ||||
| 福祉 | 地域包括支援センター | ほけん課 | ||
| 高齢者福祉 | ||||
| 障害者福祉・児童福祉・母子福祉 | 福祉課 | |||
| 生活保護 | ||||
| 保育 | 保育園・子育て支援センター | 福祉課 | ||
| 子育て世代包括支援センター | 健康増進課 | |||
| 健康 | 各種健診・予防接種・健康づくり | 健康増進課 | ||
| 母子保健・成人保健･各種健康相談･健康教室 | ||||
| 環境 | ゴミ・リサイクル | 市民課 | ||
| 犬の注射・登録 | ||||
| 環境保全・新エネルギー | 住環境課 | |||
| 浄化槽 | ||||
| 産業 経済 |
観光 | 観光課 | 総務振興係 | 総務振興係 |
| 商業・工業・労働 | まちづくり課 | |||
| 農業・林業・畜産業 | 農政課 | |||
| 農地調整・農業者年金 | 農業委員会事務局 | |||
| 教育 | 小中学校・給食・就学援助・教育相談・生涯学習・社会教育･文化振興・スポーツ施設 | 教育課 | 総務振興係 | 総務振興係 |
| 上下 水道 |
水道料金・管理・工務 | 上下水道課 | 水道分室 | 水道分室 |
| 財産区の水道料金・管理・工務 | 企画財政課 | ― | ― | |
| 下水道料金・管理・工務 | 上下水道課 | 総務振興係 | ― | |
| 住宅 | 公営住宅 | 住環境課 | 総務振興係 | 総務振興係 |
| 都市計画用途区域 | 総務振興係 | ― | ||
| 建築確認 | ― | ― | ||
| 道路 河川 |
道路・河川 | 建設課 | 総務振興係 | 総務振興係 |
| 里道･水路 | ||||
| 農道・林道・農業用水路 | 農政課 | 総務振興係 | ||
| 情報 | お知らせ端末の設置等 | 防災情報課 （情報管理室） |
総務振興係 | 総務振興係 |
| 光インターネット | ||||
| 防災 | 防災行政無線 | 防災情報課 | 総務振興係 | 総務振興係 |
| 安全安心メール | ||||
| 人権 | 人権啓発・男女共同参画 | 人権啓発課 | ― | ― |
| 市政 | 総合計画・統計 | 企画財政課 | ||
| 広報広聴・お知らせ端末の配信・市ホームページ | 総務課 | |||
| 都市計画・開発行為 | 住環境課 | |||
| 地域づくり･地域審議会 | まちづくり課 | |||
| 予算・決算分析・入札・財産管理 | 企画財政課 | |||
| 電子申請・情報化 | 防災情報課 （情報管理室） |
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| 情報公開・個人情報保護・行政改革 | 総務課 | |||
| 会計 | 歳入歳出の出納・決算 | 会計課 | ||
| 議会 | 市議会に関すること | 総務課 | ||
| 参政 | 選挙に関すること | 選挙管理委員会 事務局 |
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| 直接請求に関すること | 総務課 | |||
| 監査 | 監査に関すること | 監査委員事務局 | ||